Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.

Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему Виртуальный скрининг

Содержание

Занятие 4Виртуальный скрининг
Занятие 4Виртуальный скрининг Высокопроизводительный скрининг—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений Недостатки:Достоинства:СтоимостьВ некоторых случаях невозможно разработать подходящую Высокопроизводительный VS виртуальный скринингВиртуальный скрининг—оценка соединений вычислительными методами Виртуальный скрининг Виртуальный скринингПреимущества:СкоростьНизкая себестоимостьШирокие возможностиНедостатки:Достоверность Виртуальный скрининг Виртуальный скрининг Генерация библиотек ФильтрацияПодструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)Физико-химические свойства PAINS Pan Assay Interference CompoundsBaell & Walters, Nature, 2014, 513, 481-483 Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)Применяется:Поиск по сходству структур (similarity search)Поиск по Успехи LBVSДля испытанийДействительно испытанных Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)—докинг во всём его многообразии Дизайн de novoИдея состоит в том, чтобы собрать лиганд прямо в сайте «с нуля». SAR и QSARSAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активностьQSAR – Quantitave Structure Activity SARIC50 = 100nMIC50 = 10nMIC50 = 20nMIC50 = 1000nMIC50 < 100nMвероятно:IC50 > 100nM SAR. Примеры.Что и как можно менять?—зависит от конкретной задачиБиоизостерические заменыИзменение числа метиленовых SAR и QSARAntimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5): 2233–2244.IC50, nMhttps://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.pngPlasmodium falciparum QSAR
Слайды презентации

Слайд 2 Занятие 4
Виртуальный скрининг

Занятие 4Виртуальный скрининг

Слайд 3 Высокопроизводительный скрининг
—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений
Недостатки:


Достоинства:
Стоимость
В некоторых

Высокопроизводительный скрининг—экспресс-оценка активности больших коллекций соединений Недостатки:Достоинства:СтоимостьВ некоторых случаях невозможно разработать

случаях невозможно разработать подходящую методику

Надёжность
Высокая эффективность при правильном использовании

Слайд 4

Слайд 5 Высокопроизводительный VS виртуальный скрининг
Виртуальный скрининг
—оценка соединений вычислительными методами

Высокопроизводительный VS виртуальный скринингВиртуальный скрининг—оценка соединений вычислительными методами

Слайд 6 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 7 Виртуальный скрининг
Преимущества:

Скорость
Низкая себестоимость
Широкие возможности

Недостатки:

Достоверность

Виртуальный скринингПреимущества:СкоростьНизкая себестоимостьШирокие возможностиНедостатки:Достоверность

Слайд 8 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 9 Виртуальный скрининг

Виртуальный скрининг

Слайд 10 Генерация библиотек

Генерация библиотек

Слайд 11 Фильтрация
Подструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)
Физико-химические свойства

ФильтрацияПодструктурные дескрипторы (напр. токсофорные группы)Физико-химические свойства

Слайд 12 PAINS Pan Assay Interference Compounds
Baell & Walters, Nature,

PAINS Pan Assay Interference CompoundsBaell & Walters, Nature, 2014, 513, 481-483

2014, 513, 481-483

Слайд 13 Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)
Применяется:

Поиск по сходству

Виртуальный скрининг основанный на лиганде (LBVS)Применяется:Поиск по сходству структур (similarity search)Поиск

структур (similarity search)
Поиск по сходству фармакофора
На основе значений дескрипторов

Слайд 14 Успехи LBVS
Для испытаний
Действительно испытанных

Успехи LBVSДля испытанийДействительно испытанных

Слайд 15 Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)
—докинг во всём

Виртуальный скрининг основанный на мишени (TBVS)—докинг во всём его многообразии

его многообразии

Слайд 16 Дизайн de novo
Идея состоит в том, чтобы собрать

Дизайн de novoИдея состоит в том, чтобы собрать лиганд прямо в сайте «с нуля».

лиганд прямо в сайте «с нуля».

Слайд 17 SAR и QSAR
SAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активность

QSAR

SAR и QSARSAR—Structure Activity Relationships. Поиск зависимости структура-активностьQSAR – Quantitave Structure

– Quantitave Structure Activity Relationships. Поиск количественной зависимости структура-активность

Слайд 18 SAR
IC50 = 100nM
IC50 = 10nM
IC50 = 20nM
IC50 =

SARIC50 = 100nMIC50 = 10nMIC50 = 20nMIC50 = 1000nMIC50 < 100nMвероятно:IC50 > 100nM

1000nM
IC50 < 100nM
вероятно:
IC50 > 100nM

Слайд 19 SAR. Примеры.
Что и как можно менять?
—зависит от конкретной

SAR. Примеры.Что и как можно менять?—зависит от конкретной задачиБиоизостерические заменыИзменение числа

задачи
Биоизостерические замены
Изменение числа метиленовых групп
Изменение степени ненасыщенности
Введение или удаление

циклических систем

Слайд 20 SAR и QSAR
Antimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5):

SAR и QSARAntimicrob Agents Chemother. 2011 May; 55(5): 2233–2244.IC50, nMhttps://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.pngPlasmodium falciparum

2233–2244.
IC50, nM
https://ru.wikipedia.org/wiki/Plasmodium_falciparum#/media/File:Plasmodium_falciparum_01.png
Plasmodium falciparum

  • Имя файла: virtualnyy-skrining.pptx
  • Количество просмотров: 111
  • Количество скачиваний: 0
- Предыдущая Значение корней в жизни растений
Следующая - Максим Рыльский

Похожие презентации

Медицинская психология Медицинская психология 101
Питание в профилактике и коррекции общего и частного синдрома перенапряжения, а также перетренированности у спортсменов Питание в профилактике и коррекции общего и частного синдрома перенапряжения, а также перетренированности у спортсменов 158
Кесар тілігі Кесар тілігі 157
Антропоцентрический эталон здоровья Антропоцентрический эталон здоровья 110
Профилактика нарушений осанки и гиподинамии при работе с компьютером Профилактика нарушений осанки и гиподинамии при работе с компьютером 102
10.6 флави, фила, рабдо 10.6 флави, фила, рабдо 100
Болезнь Фабри Болезнь Фабри 117
Возбудители вирусных инфекций Возбудители вирусных инфекций 114
Введення в неврологію. Принципи структури і функції нервової системи. Синдроми руху. Синдром паркінсонізму Введення в неврологію. Принципи структури і функції нервової системи. Синдроми руху. Синдром паркінсонізму 99
Вич-инфекция Вич-инфекция 97
Выделительная система Выделительная система 113
Подростковая беременность Подростковая беременность 141
Средостение переднее и заднее Средостение переднее и заднее 146
Клинические проявления формы КПЛ Клинические проявления формы КПЛ 96
Картина крови при различных видах анемий Картина крови при различных видах анемий 107
Стоматология. Современные оттискные материалы Стоматология. Современные оттискные материалы 98
Алгоритм выявления ФР гипертонической болезни Алгоритм выявления ФР гипертонической болезни 113
Мұрынның алдыңғы тампонадасын өткізу Мұрынның алдыңғы тампонадасын өткізу 101
Контроль за распространением инфекции Контроль за распространением инфекции 94
Лимфаденопатии в инфекционной патологии Лимфаденопатии в инфекционной патологии 100
Сифилис. Общее течение сифилиса Сифилис. Общее течение сифилиса 96
Скарлатина Скарлатина 103
Медицинская паразитология Медицинская паразитология 133
Анатомия и физиология ЦНС Анатомия и физиология ЦНС 150
МГМСУ - Рентгенодиагностика заболеваний органов грудной клетки МГМСУ - Рентгенодиагностика заболеваний органов грудной клетки 139
Спортшыларға арналған тағамдар Спортшыларға арналған тағамдар 176
ЭКГ ЭКГ 105
Жатыр денесінің обыры Жатыр денесінің обыры 136
Отличия прокариотической клетки от эукариотической Отличия прокариотической клетки от эукариотической 133
Суточное мониторирование артериального давления Суточное мониторирование артериального давления 96