Презентация на тему Частицы

(Å-1)
Область Гинье
Область формы частицы

Область, где выявляются детали внутренней структуры

0.01 0.1 0.2

в области малых углов интенсивность рассеяния может быть представлена

Аппроксимация Гинье

Это уравнение известно как аппроксимация Гинье. Оно верно для частицы любой формы при условии что произведение QRG меньше или равно 1.

Rg = 52 Å,

M =50 кДа

Рассеяние нейтронов

Свойство 1. Радиус инерции однородной частицы не зависит от

Свойство 3. Радиус инерции двух сферических частиц зависит от расстояния
между ними L

Свойство 4. Радиус инерции совокупности сферических частиц зависит от
их распределения в пространстве

1

2

3

1

2

3

3

1

2

2

1

3

ro

от распределения

ρ2

ρ1

ρ2

ρ2

ρ2

ρ1

ρ1

ρ1

Rg Rg Rg Rg

ρ2 =0 ρ1 > ρ2 ρ1 = ρ2 ρ1 < ρ2

Свойство 6. Для частиц простой формы радиус инерции связан с их
геометрическими размерами следующим образом

от распределения

ρ2

ρ1

ρ2

ρ2

ρ2

ρ1

ρ1

ρ1

Rg > Rg > Rg > Rg

ρ2 =0 ρ1 > ρ2 ρ1 = ρ2 ρ1 < ρ2

Свойство 6. Для частиц простой формы радиус инерции связан с их
геометрическими размерами следующим образом

белка в компактной форме равен 26 Å

т-РНК (●)

eEF1A:tRNA=3:1 (▼)

eEF1A (○)
eEF1A:tRNA=1:3 (Δ)

Расчетный Rg для белка в составе комплекса равен 28 Å.

Элонгационный эукариотический фактор eF1A не являeтся
глобулярным белком в обычном понимании, а относится
к классу природно неструктурированных белков.

Такие белки не имеют уникальной третичной структуры в физиологических условиях, а приобретают ее при
взаимодействии с лигандами”

М=50 кDa

Фактор EF1A в изолированном состоянии и в комплексе с лигандом (т-РНК)

инерции и константа поступательного трения
Радиус инерции и характеристическая вязкость




Функции

γmin=4.22

αmin=1.96

Da, D=10.8×10-7 cm2/sec, s =2.08 S
υ=0.741 cm3/g, [η]=3.1 cm3/g,

M=465.000 Da, D=3.64×10-7 cm2/sec, s =17.6 S
υ=0.747 cm3/g, [η]=3.2 cm3/g, Rg =51.9 Å
α=2.20, γs=4.60, γD=4.63.

M=890.000 Da, D=3.61×10-7 cm2/sec, s =67 S
υ=0.51 cm3/g, [η]=3.0 cm3/g, Rg =37.3 Å
α=1.7, γs=3.43, γD=3.38.

M=1.65 ×106 Da, D=1.87×10-7 cm2/sec, s =50.0 S
υ=0.61 cm3/g, [η]=3.8 cm3/g, Rg =75.0 Å
γs=3.42, γD=3.43.

•

•

форма которых близка к сферической
I

ЧТ 02 12




ЧТ 02 12

ЧТ 02 12

Номера автомобилей
Книгопечатание
Цирковые фокусы

контраст
Контраст в рассеянии
света
Контраст в рассеянии
рентгеновских

Контраст в рассеянии
нейтронов

На практике не может быть изменен

На практике достига- ется за счет изменения свойств растворителя

На практике достигается как за счет изменения свойств раство- рителя, так и свойств частицы.

|Q|=4π/λ×sinθ

веществ в растворитель.
Зависимость квадрата радиуса инерции миоглобина кашалота от

Бесконечый контраст

Изменение рассеивающих свойств растворителя (использование

компенсации

α < 0, β=0
α = 0, β=0
α >

α < 0, β=0 означает, что менее плотная компонента находится в центре частицы

α > 0, β=0 означает, что более плотная компонента находится в центре частицы

α =0, β=0 означает, что оба компонента в частице равномерно перемешаны.

Неравенство β нулю означает, что центры тяжести компонент смещены друг относительно

aH = -3.74×10-13 aD = +6.69 ×10-13
aN = +9.40×10-13 aO = +5.80 ×10-13
aP = +5.11×10-13 aC = +6.05 ×10-13

процентного содержания тяжёлой воды в смеси
Наклон каждой прямой

При бесконечном отрицательном или положительном контрасте проявляется форма частицы

При малом контрасте проявляется внутренняя структура

дейтерирование
(H)-РНК в H2O

(H)-РНК в D2O

(D)-РНК в D2O


(H)-белок в H2O

(H)-белок

где Y-доля D2O в смеси H2O/D2O, S- доля D2O в среде выращивания

Оптическая
плотность

Время в часах. a) H2O; b) 78% D2O; 100% D2O

H















30S*50S
30S*50S

30S*50S

30S*50S



30S*50S
H
Растворитель 91% D2O

D
H
H






D
D
D
H
D





30S*50S

H
H

D

элонгационным фактором (полупрозрачный розовый) и после (желтый)(Valle et al.,

У большого пестрого дятла трель идет со скоростью 20-27 ударов в секунду.
У малого пестрого дятла - 50 ударов в секунду (Энциклопедия)

Hoppe and P. Moore)


















L
_
=
Пространственное расположение 21 белков в 30S

L

_

=

полученная методом ЯМР.
Рентгеновская структура 30S рибосомной частицы T. th.

Структура 30S рибосомной субчастицы Т. termophilus

Вторичная структура 16S РНК и ее три домена: 5’-домен (красный), центральный домен (зеленый) и 3’- домен (желтый) и 3’ малый домен (голубой)

замещения (М. Павлов и И. Сердюк)







-

H
D
H,D
H,D
=


H,D



D
D


H,D
H,D


H,D

Раствор 1

«Одна» частица