Что такое findslide.org?

FindSlide.org - это сайт презентаций, докладов, шаблонов в формате PowerPoint.


Для правообладателей

Обратная связь

Email: Нажмите что бы посмотреть 

Яндекс.Метрика

Презентация на тему 12 дуплетный код

Содержание

Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и РНК = «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.
12 ДУПЛЕТНЫЙ КОДТурнир юных биологов 2007 Генетический код – это  Способ записи информации о первичной структуре белков Каким должен быть дуплетный кодЧисло возможных дуплетов = 16 Им можно закодировать Наш метод создания кода:Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154 а.к.);Разделили Проблема глицина:считать глицин полярной или неполярной а.к.?Мы считали неполярной, потому что:Gly – Знаком начала гена мы выбралиСТАРТ-кодон АУ    кодирует Мет, а Идеальный дуплетный код Свойства дуплетного кода:Отсутствие межкодонных знаков препинанияНаличие межгенных знаков препинанияОднозначностьНеперекрываемостьДуплетностьНет вырожденности (избыточности)Экономичность (на Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетныйОдин из ПомехоустойчивостьX Y   1  2Консервативная замена – не меняет класс Гидрофобные (неполярные)Классификация аминокислот по полярности радикалаГидрофильныеПолярныеЗаряженные (ионы)+─ Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).Число радикальных замен = 40, А консервативных - 44, Недостатки дуплетного кода:Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот.Возможный путь преодоления:  Посттрансляционная модификация Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al.Примеры пострансляционной модификации аминокислот Недостатки дуплетного кода:Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп~1,1) Нет вырожденности (избыточности). ЛитератураВ.А. Ратнер. Молекулярно-генетические системы управления. Наука, Новосибирск, 1981.
Слайды презентации

Слайд 2 Генетический код – это
Способ записи информации

Генетический код – это Способ записи информации о первичной структуре белков

о первичной структуре белков через последовательность нуклеотидов ДНК и

РНК
= «Словарь» перевода с языка нуклеиновых кислот на язык белков.

Слайд 3 Каким должен быть дуплетный код
Число возможных дуплетов =

Каким должен быть дуплетный кодЧисло возможных дуплетов = 16 Им можно

16
Им можно закодировать не более 15 а.к.
один

из дуплетов – на СТОП-кодон

Слайд 4 Наш метод создания кода:
Выбрали белки лизоцим (129 а.к.)

Наш метод создания кода:Выбрали белки лизоцим (129 а.к.) и миоглобин (154

и миоглобин (154 а.к.);
Разделили а.к. на две группы:

а) обязательно кодируемые
б) с похожими радикалами
Посмотрели, какие а.к. наиболее часто встречаются в данных белках;
Подобрали дуплеты и а.к. так, чтобы коэффициент q был как можно больше.

Слайд 5 Проблема глицина:

считать глицин полярной или неполярной а.к.?
Мы считали

Проблема глицина:считать глицин полярной или неполярной а.к.?Мы считали неполярной, потому что:Gly

неполярной, потому что:
Gly – п: qтр=1,16
Gly – н/п: qтр=1,28


Слайд 7 Знаком начала гена мы выбрали
СТАРТ-кодон АУ

Знаком начала гена мы выбралиСТАРТ-кодон АУ  кодирует Мет, а в

кодирует Мет, а в начале гена фМет.
(в триплетном

АУГ)
Знак окончания гена –
СТОП-кодон УА
(в триплетном УАА, УАГ, УГА)


Слайд 8 Идеальный дуплетный код

Идеальный дуплетный код

Слайд 9 Свойства дуплетного кода:
Отсутствие межкодонных знаков препинания
Наличие межгенных знаков

Свойства дуплетного кода:Отсутствие межкодонных знаков препинанияНаличие межгенных знаков препинанияОднозначностьНеперекрываемостьДуплетностьНет вырожденности (избыточности)Экономичность

препинания
Однозначность
Неперекрываемость
Дуплетность
Нет вырожденности (избыточности)
Экономичность (на белок той же длины нужно

меньше ДНК)

Слайд 10 Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный

Сравним эти два кода – построенный нами дуплетный и стандартный триплетныйОдин

и стандартный триплетный
Один из самых важных параметров - помехоустойчивость


Слайд 11 Помехоустойчивость
X Y
1 2
Консервативная замена

ПомехоустойчивостьX Y  1 2Консервативная замена – не меняет класс аминокислотыРадикальная замена – меняет класс аминокислоты

– не меняет класс аминокислоты
Радикальная замена – меняет класс

аминокислоты



Слайд 12 Гидрофобные (неполярные)
Классификация аминокислот по полярности радикала





Гидрофильные
Полярные
Заряженные (ионы)
+

Гидрофобные (неполярные)Классификация аминокислот по полярности радикалаГидрофильныеПолярныеЗаряженные (ионы)+─

Слайд 13 Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).
Число радикальных замен = 40,

Подсчёт коэффициента помехоустойчивости (q).Число радикальных замен = 40, А консервативных -


А консервативных - 44,
Учитывая, что глицин – неполярная

аминокислота и не включая кодон УА
q = 44/40 = 1,1.

Слайд 14 Недостатки дуплетного кода:
Таким кодом невозможно закодировать больше, чем

Недостатки дуплетного кода:Таким кодом невозможно закодировать больше, чем 15 аминокислот.Возможный путь преодоления: Посттрансляционная модификация

15 аминокислот.
Возможный путь преодоления:
Посттрансляционная модификация


Слайд 15 Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al.
Примеры пострансляционной модификации

Molecular Cell Biology Harvey Lodish et al.Примеры пострансляционной модификации аминокислот

аминокислот


Слайд 16 Недостатки дуплетного кода:
Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у

Недостатки дуплетного кода:Коэффициент помехоустойчивости (q) меньше, чем у триплетного кода (qтр~1,28, а qдп~1,1) Нет вырожденности (избыточности).

триплетного кода (qтр~1,28, а qдп~1,1)
Нет вырожденности (избыточности).


  • Имя файла: 12-dupletnyy-kod.pptx
  • Количество просмотров: 122
  • Количество скачиваний: 0